De naturhistoriske samlinger inneholder botaniske, geologiske og zoologiske utstillinger.
I den zoologiske avdelingen er store deler av utstillingene av eldre dato. Her finnes dyr, fugl og fisk fra hele verden- en eventyrverden fra fordums tid.
Utstillingen Menneskets utvikling gir spennende innblikk i våre forfedres liv.
De geologiske utstillingene viser de fleste tema innen geologi. Særlig attraktiv er mineralsamlingen der både prakteksemplarer fra hele verden og fine lokale prøver er utstilt. I en egen avdeling vises viktige sider av Norges dynamiske oljeindustri. Av botaniske utstillinger innendørs kan nevnes Grønn evolusjon- om plantenes utvikling.

Musehagen er på sitt vakreste om våren og sommeren, og i Veksthuset kan man studere tropiske planter hele året.

Billett gjelder samme dag for både De kulturhistoriske og De naturhistoriske samlinger.